Транскриптомика
Выполняем RNA-seq для комплексного исследования транскриптома с использованием специализированных протоколов для различных типов образцов и исследовательских задач, а также биоинформатический анализ полученных данных. Полный цикл работ — от приема образцов до передачи результатов исследования.
Каталог услуг
Не нашли подходящую услугу? Свяжитесь с нами info@igenome.ru — мы поможем подобрать решение под вашу исследовательскую задачу или предложим индивидуальный протокол.
Что важно знать перед заказом
Для большинства услуг раздела действуют единые требования к образцам, условиям транспортировки и формату предоставления результатов.
- Платформа секвенированияВсе исследования выполняются на секвенаторе DNBSEQ-G400 (MGISEQ-2000).1
- Срок
выполнения- Секвенирование — до 45 рабочих дней.
- Биоинформатический анализ — до 10 рабочих дней.
2 - Какой материал
можно предоставить- Свежая кровь;
- Замороженная кровь;
- Клеточный осадок;
- Биоптат;
- Суспензию клеток в TRIzol;
- Выделенная РНК.
3 - Требования
к РНКПри предоставлении выделенной ДНК:- A260/A280 — 1,9–2,1;
- A260/A230 — более 2,0;
- количество — не менее 500 нг;
- RIN (RNA Integrity Number) — более 7;
- буфер — mQ или TE.
4 - Условия
транспортировки- выделенная РНК, клеточный осадок, биоптат и замороженная кровь — при −40…−80 °C;
- свежая кровь и суспензия клеток в TRIzol — при +4 °C.
5 - Формат
результатовБез биоинформатического анализа:- Сырые данные секвенирования в формате FASTQ (*.fastq.gz).
С биоинформатическим анализом:- QC-отчеты;
- Аннотированные файлы VCF / матрицы экспрессии (в зависимости от типа исследования);
- Графики и визуализации результатов;
- Интерпретационный отчет;
- Исходные и обработанные данные.
6
Не уверены, какая услуга подойдет для вашей задачи?
Оставьте адрес электронной почты, и наши специалисты свяжутся с вами, помогут подобрать подходящее исследование и ответят на ваши вопросы.